Dada a ausência de pré-inscrições de alguns clubes, a Federação Portuguesa de Natação procedeu a alguns reajustamentos na 3.ª e 4.ª Divisões Nacionais.
O CNBE, a ADP e o CDF, quinto, sexto e sétimo classificados, respectivamente, da 4.ª Divisão masculina na época 2008/09, e o Sporting de Espinho, quinto classificado feminino, sobem ao terceiro escalão na actual temporada, devido às não inscrições do CDUP em masculinos e femininos e do CNFA e o AVQA em masculinos.
Da fase de qualificação para a 4.ª Divisão apuram-se sete clubes, quer do sector masculino, quer do sector feminino, devido à não inscrição do CNRM e do AVQA em femininos.
Não houve desistências nas duas principais Divisões.
